ASIGNATURAS POSTGRADO EN SISTEMA DIGESTIVO

ASIGNATURA 1 - CONTEXTUALIZACIÓN, EVOLUCIÓN, SISTEMA INMUNE Y SISTEMA DIGESTIVO

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

Contextualización, evolución, sistema inmune y sistema digestivo

Datos generales

  • Profesor: Néstor Sánchez.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

  • Encuadre de la microbiota y su importancia sobre nuestra salud.
  • La primera ventana de oportunidad: Alimentación y primeros años de vida.
  • Alteración de la microbiota y cómo diagnosticarlo.
  • Alimentación y microbiota. De la nutrición a la vida prebiótica.
  • Microbiota y sistema inmune. La microbiota al servicio del Inmunometabolismo.
  • Particularidades según patología y conclusiones finales.

 

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

 

Bibliografía

  • Belizário, J.E., Faintuch, J., & Garay-Malpartida, M. (2018). Gut Microbiome Dysbiosis and Immunometabolism: New Frontiers for Treatment of Metabolic Diseases. Mediators of Inflammation, 2018.
  • Costantini L, Molinari R, Farinon B, Merendino N. Impact of Omega-3 Fatty Acids on the Gut Microbiota. Int J Mol Sci. 2017 Dec 7;18(12):2645.
  • Fasano A. All disease begins in the (leaky) gut: role of zonulin-mediated gut permeability in the pathogenesis of some chronic inflammatory diseases. F1000Res. 2020;9:F1000 Faculty Rev-69. Published 2020 Jan 31. doi:10.12688/f1000research.20510.1
  • Knight, R., Callewaert, C., Marotz, C., Hyde, E. R., Debelius, J. W., McDonald, D., & Sogin, M. L. (2017). The Microbiome and Human Biology. Annual Review of Genomics and Human Genetics, 18(1), 65–86.
  • Koropatkin NM, Cameron EA, Martens EC.” How glycan metabolism shapes the human gut microbiota.”Nat Rev Microbiol. 2012 Apr 11;10(5):323-35.
  • Leino L, Tall T, Helander M, Saloniemi I, Saikkonen K, Ruuskanen S, Puigbò P. Classification of the glyphosate target enzyme (5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase) for assessing sensitivity of organisms to the herbicide. J Hazard Mater.
  • Michaudel C, Sokol H. The Gut Microbiota at the Service of Immunometabolism. Cell Metab. 2020 Oct 6;32(4):514-523.
  • O’Hara, A. M., & Shanahan, F. (2006). The gut flora as a forgotten organ. EMBO Reports, 7(7), 688–693.
  • Paoli, A., Mancin, L., Bianco, A., Thomas, E., Mota, J. F., & Piccini, F. (2019). Ketogenic Diet and Microbiota: Friends or Enemies? Genes, 10(7), 534.
  • Rodríguez-Daza MC, Pulido-Mateos EC, Lupien-Meilleur J, Guyonnet D, Desjardins Y and Roy D (2021) Polyphenol-Mediated Gut Microbiota Modulation: Toward Prebiotics and Further. Front. Nutr. 8:689456
  • Sorbara MT, Pamer EG. Microbiome-based therapeutics. Nat Rev Microbiol. 2022 Jan 6.
  • Sicard J-F, Le Bihan G, Vogeleer P, Jacques M and Harel J (2017) Interactions of Intestinal Bacteria with Components of the Intestinal Mucus. Front. Cell. Infect. Microbiol. 7:387.
  • Sommer F, Bäckhed F. “The gut microbiota--masters of host development and physiology.” Nat Rev Microbiol. 2013 Apr;11(4):227-38. doi: 10.1038/nrmicro2974. Epub 2013 Feb 25.
  • Tamburini, S. Shen, N. Chih Wu, H. Clemente, JC. “ The microbiome in early life: implications for health outcomes. Nature Medicine volume 22, num 7. july 2016
  • Vangay P, Ward T, Gerber JS, Knights D. Antibiotics, pediatric dysbiosis, and disease. Cell Host Microbe. 2015 May 13;17(5):553-64.
VOLVER AL TEMARIO

ASIGNATURA 2 - PRINCIPIOS DE LA MICROBIOTA Y SU IMPLICACIÓN EN LA ENFERMEDAD

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

Principios de la microbiota y su implicación en la enfermedad

Datos generales

  • Profesor: Rubén López Aladid.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

1- Microbiota y sistema inmune
2- Microbiota y sistema inmune relacionado con la enfermedad
3- Microbiota respiratorio
4- Microbiota y marcadores inflamatorios en las enfermedades respiratorias crónicas: Las bronquiectasias
5- Microbiota, obesidad y huésped / Medicina personalizada mediante análisis de microbioma

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

 

Bibliografía

  • WHO. Obesity and overweight. [Internet]. 2021. Available from:
    https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight.
  • Ng M, Fleming T, Robinson M, Thomson B, Graetz N, Margono C, et al. Global,
    regional, and national prevalence of overweight and obesity in children and adults during 1980–2013: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2013. Lancet. 2014 Aug 30;384(9945):766–81.
  • Visser M, Bouter LM, McQuillan GM, Wener MH, Harris TB. Low-grade systemic inflammation in overweight children. Pediatrics. 2001;107(1):E13.
  • Mraz M, Haluzik M. The role of adipose tissue immune cells in obesity and low-grade inflammation. Vol. 222, Journal of Endocrinology. BioScientifica Ltd.; 2014. p. 113–27.
  • Razquin C, Marti A, Martinez JA. Evidences on three relevant obesogenes: MC4R, FTO and PPARγ. Approaches for personalized nutrition. Mol Nutr Food Res. 2011;55(1):136–49.
  • Vaisse C, Clement K, Guy-Grand B, Froguel P. A frameshift mutation in human MC4R is associated with a dominant form of obesity. Nat Genet. 1998;20(2):113–4.
  • Yeo GSH, Farooqi IS, Aminian S, Halsall DJ, Stanhope RG, O’Rahilly S. A frameshiftmutation in MC4R associated with dominantly inherited human obesity. Nat Genet. 1998;20(2):111–2.Diabetes. 1998;47(4):507–14.
  • Spiegelman BM. PPAR-gamma: adipogenic regulator and thiazolidinedione receptor.
  • Vimaleswaran KS, Loos RJF. Progress in the genetics of common obesity and type 2 diabetes. Expert Rev Mol Med. 2010 Feb;12.
  • Scuteri A, Sanna S, Chen WM, Uda M, Albai G, Strait J, et al. Genome-Wide Association Scan Shows Genetic Variants in the FTO Gene Are Associated with Obesity-Related Traits. PLoS Genet. 2007 Jul;3(7):1200–10.
  • Oriach CS, Robertson RC, Stanton C, Cryan JF, Dinan TG. Food for thought: The roleof nutrition in the microbiota-gut–brain axis. Clin Nutr Exp. 2016 Apr 1;6:25–38.
  •  Kumar H, Lund R, Laiho A, Lundelin K, Ley RE, Isolauri E, et al. Gut Microbiota as anEpigenetic Regulator: Pilot Study Based on Whole-Genome Methylation Analysis. 2014;
  • Turnbaugh PJ, Ley RE, Mahowald MA, Magrini V, Mardis ER, Gordon JI. An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest. Nat 2006 4447122. 2006 Dec 21;444(7122):1027–31.
  • Tilg H, Kaser A. Gut microbiome, obesity, and metabolic dysfunction. J Clin Invest. 2011 Jun 1;121(6):2126–32.
  • Devaux CA, Raoult D. The microbiological memory, an epigenetic regulator governing the balance between good health and metabolic disorders. Front Microbiol. 2018 Jun26;9(JUN):1379.
  • Cuevas-Sierra A, Ramos-Lopez O, Riezu-Boj JI, Milagro FI, Martinez JA. Diet, Gut Microbiota, and Obesity: Links with Host Genetics and Epigenetics and Potential Applications. Adv Nutr. 2019 Jan 1;10(suppl_1):S17–30.
  • Allin KH, Nielsen T, Pedersen O. MECHANISMS IN ENDOCRINOLOGY: Gut microbiota in patients with type 2 diabetes mellitus. Eur J Endocrinol. 2015 Apr 1;172(4):R167–77.
  • Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Human gut microbes associated with obesity. Nat 2006 4447122. 2006 Dec 21;444(7122):1022–3.
  • Pascal V, Pozuelo M, Borruel N, Casellas F, Campos D, Santiago A, et al. A microbial signature for Crohn’s disease. Gut. 2017 May 1;66(5):813–22.
  • Maeda Y, Takeda K. Role of Gut Microbiota in Rheumatoid Arthritis. J Clin Med 2017, Vol 6, Page 60. 2017 Jun 9;6(6):60.
  • Janssen AWF, Houben T, Katiraei S, Dijk W, Boutens L, Van Der Bolt N, et al. Modulation of the gut microbiota impacts nonalcoholic fatty liver disease: a potential role for bile acids. J Lipid Res. 2017 Jul 1;58(7):1399–416.
  • Yu TC, Guo F, Yu Y, Sun T, Ma D, Han J, et al. Fusobacterium nucleatum Promotes Chemoresistance to Colorectal Cancer by Modulating Autophagy. Cell. 2017 Jul 27;170(3):548-563.e16.
  • Yuille S, Reichardt N, Panda S, Dunbar H, Mulder IE. Human gut bacteria as potent class I histone deacetylase inhibitors in vitro through production of butyric acid and valeric acid. PLoS One. 2018 Jul 1;13(7):e0201073.
VOLVER AL TEMARIO

ASIGNATURA 3 - TEST CLÍNICOS: MICROBIOTA

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

Test clínicos: Microbiota

Datos generales

  • Profesor: Roque Pastor.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

El programa se compone de dos bloques:

Bloque 1: La Microbiota: una visión desde el laboratorio
Clases I, II, III y IV

Clase I:
Introducción a la metagenómica
Visión general de un estudio metagenómico

Clase II:
Estrategia a seguir: toma de decisiones
Selección de participantes
Recogida de muestras
Técnica extracción DNA

Clase III:
Secuenciación del ADN

Clase IV:
Interpretación de los datos en estudios metagenómicos

 

Bloque 2: Fármacos y la microbiota
Clase V

Clase V:
Fármacos y la microbiota:
Antibióticos
Fármacos NO antibióticos
La microbiota y la eficacia de los fármacos con interacción

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

 

Bibliografía

  • Ilhan, Z. E. (2016). Microbiome after bariatric surgery and microbial insights into surgical weight loss. Arizona State University.
  • Greathouse, K. L., Sinha, R., & Vogtmann, E. (2019). DNA extraction for human microbiome studies: the issue of standardization. Genome biology, 20(1), 1-4.
  • Costea, P. I., Zeller, G., Sunagawa, S., Pelletier, E., Alberti, A., Levenez, F., ... & Bork, P. (2017). Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nature biotechnology, 35(11), 1069-1076.
  • Angelakis, E., Bachar, D., Henrissat, B., Armougom, F., Audoly, G., Lagier, J. C., ... & Raoult, D. (2016). Glycans affect DNA extraction and induce substantial differences in gut metagenomic studies. Scientific reports, 6(1), 1-8.
  • Lagier, J. C., Khelaifia, S., Alou, M. T., Ndongo, S., Dione, N., Hugon, P., ... & Raoult, D. (2016). Culture of previously uncultured members of the human gut microbiota by culturomics. Nature microbiology, 1(12), 1-8.
  • Weersma, R. K., Zhernakova, A., & Fu, J. (2020). Interaction between drugs and the gut microbiome. Gut, 69(8), 1510-1519.
VOLVER AL TEMARIO

ASIGNATURA 4 - EJE MICROBIOTA-INTESTINO-CEREBRO

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

Eje Microbiota-Intestino-Cerebro

Datos generales

  • Profesor: Xavi Cañellas.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

1- El origen
2- Enteric Nervous System (ENS)
3- Vías de Comunicación
4- Introducción a la Neuroinflamación
5- Particularidades del eje MGB

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

Bibliografía

  • Microbial reconstitution reverses maternal diet-induced social and synaptic deficits in offspring. Shelly A. Buffington, Gonzalo Viana Di Prisco, Thomas A. Auchtung, Nadim J. Ajami, Joseph F. Petrosino and Mauro Costa-Mattioli.
  • The Microbiome and Host Behavior Helen E. Vuong, Jessica M. Yano, Thomas C. Fung, Elaine Y. Hsiao
  • The microbiome in early life: implications for health outcomes Sabrina Tamburini, Nan Shen, Han Chih Wu & Jose C Clement
  • Early life interaction between the microbiota and the Enteric Nervous System. Jaime Foong, Lin Y Hung , S Poon, Tor C Savidge2 ,Joel C Bornstein.
  • Enteric nervous system development: migration, differentiation, and disease Jonathan I. Lake and Robert O. Heuckeroth.
  • Impact of Intestinal Peptides on the Enteric Nervous System: Novel Approaches to Control Glucose Metabolism and Food Intake. Anne Abot, Patrice D. Cani and Claude Knauf.
  • The Microbiota-Gut-Brain Axis in Neuropsychiatric Disorders: Pathophysiological Mechanisms and Novel Treatments. Yong-Ku Kim and Cheolmin Shin.
  • Breaking down the barriers: the gut microbiome, intestinal permeability and stress-related psychiatric disorders. John R. Kelly, Paul J. Kennedy, John F. Cryan, Timothy G. Dinan, Gerard Clarke and Niall P. Hyland.
  • Tryptophan metabolism in the central nervous system: medical implications. Jon P. Ruddick, Andrew K. Evans , David J. Nutt, Stafford L. Lightman, Graham A.W. Rook and Christopher A. Lowry.
  • Microbiota-gut-brain axis in health and disease: Is NLRP3 inflammasome at the crossroads of microbiota-gut-brain communications? Carolina Pellegrinia, Luca Antoniolib, Vincenzo Calderonea, Rocchina Coluccic, Matteo Fornaib, Corrado Blandizzib.
  • The Neuroendocrinology of the Microbiota-Gut-Brain Axis: A Behavioural Perspective Sofia Cussotto, Kiran V. Sandhu, Timothy G. Dinan, John F. Cryan.
  • Microbiota-Brain-Gut Axis and Neurodegenerative Diseases Eamonn M. M. Quigley.
  • Feeding melancholic microbes: MyNewGut recommendations on diet Q6 and mood Q5 Timothy G. Dinan, Catherine Stanton, Caitriona Long-Smith, Paul Kennedy, John F. Cryan, Caitlin S.M. Cowan, María Carmen Cenit, Jan-Willem van der Kamp, Yolanda Sanz.
  • Role of the gut microbiota in host appetite control: bacterial growth to animal feeding behaviour. Sergueï O. Fetissov.
  • Why does the microbiome affect behaviour? Katerina V.-A. Johnson and Kevin R. Foster.
VOLVER AL TEMARIO

ASIGNATURA 5 - EL IMPACTO DE LA MICROBIOTA EN LAS PATOLOGÍAS NEUROLÓGICAS

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

El impacto de la microbiota en las patología neurológicas

Datos generales

  • Profesor: Antonio Valenzuela.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

  • Neuroinflamación: la clave de la inmunoneurología.
  • Eje-boca/intestino-cerebro y neuroinflamación.
  • Depresión“Bugs in the Brain”.
  • El microbioma. ¿Una diana para la Enfermedad de Alzheimer?
  • Apuntando al intestino para tratar la esclerosis múltiple.
  • La enfermedad de Parkinson, una patología intestinal.

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

 

Bibliografía

  • Miller AH, Raison CL. The role of inflammation in depression: from evolutionary imperative to modern treatment target. Nat Rev Immunol. 2016 Jan;16(1):22-34. doi: 10.1038/nri.2015.5. PMID: 26711676; PMCID: PMC5542678.
  • Zhu S, Jiang Y, Xu K, Cui M, Ye W, Zhao G, Jin L, Chen X. The progress of gut microbiome research related to brain disorders. J Neuroinflammation. 2020 Jan 17;17(1):25. doi: 10.1186/s12974-020-1705-z. PMID: 31952509; PMCID: PMC6969442.
  • Fulton S, Décarie-Spain L, Fioramonti X, Guiard B, Nakajima S. The menace of obesity to depression and anxiety prevalence. Trends Endocrinol Metab. 2022 Jan;33(1):18-35. doi: 10.1016/j.tem.2021.10.005. Epub 2021 Nov 5. PMID: 34750064.
  • van Olst L, Roks SJM, Kamermans A, Verhaar BJH, van der Geest AM, Muller M, van der Flier WM and de Vries HE (2021) Contribution of Gut Microbiota to Immunological Changes in Alzheimer’s Disease. Front. Immunol. 12:683068. doi: 10.3389/fimmu.2021.683068
  • Ghezzi L, Cantoni C, Pinget GV, Zhou Y, Piccio L. Targeting the gut to treat multiple sclerosis. J Clin Invest. 2021 Jul 1;131(13):e143774. doi: 10.1172/JCI143774.
    PMID: 34196310; PMCID: PMC8245171.
  • Boulos C, Yaghi N, El Hayeck R, Heraoui GN, Fakhoury-Sayegh N. Nutritional Risk Factors, Microbiota and Parkinson’s Disease: What Is the Current Evidence? Nutrients. 2019; 11(8):1896. https://doi.org/10.3390/nu11081896
VOLVER AL TEMARIO

ASIGNATURA 6 - MICROBIOTA CUTÁNEA Y LAS CONSECUENCIAS DE SU DESEQUILIBRIO

Postgrado en Microbiota

ASIGNATURA

Microbiota cutánea y las consecuencias de su desequilibrio

Datos generales

  • Profesor: Dra. Ivana Corona.
  • Idioma de las clases expositivas: Castellano.

Temas de la Asignatura

1- Características de la microbiota de la piel
2- Rol de la microbiota en la rosácea
3- Rol de la microbiota en el acné
4- Rol de la microbiota en la dermatitis seborreica
5- Rol de la microbiota en la dermatitis atópica
6- Rol de la microbiota en el envejecimiento cutáneo

Evaluación y calificación
Examen tipo test – 100% de la nota final de la asignatura.
*Es imprescindible una nota mínima de 50%.

Bibliografía

  • Skin-gut axis: The relationship between intestinal bacteria and skin health. Vaughn AR, Notay M, Clark AK, Sivamani RK
  • Skin microbiome alterations in seborrheic dermatitis and dandruff: A systematic review. Rong | Ruoyu | Ruojun Wang
  • Topical Probiotics in Dermatological Therapy and Skincare: A Concise Review Katlein Franc.
  • Human Microbiome: Composition and Role in Inflammatory Skin Diseases. Anna Balato · Sara Cacciapuoti · Roberta Di Caprio  · Claudio Marasca  · Anna Masarà · Annunziata Raimondo · Gabriella Fabbrocin.
  • Rosacea and the Microbiome: A Systematic Review Hala Daou. Michela Paradiso. Kerry Hennessy. Lucia Seminario-Vidal.
VOLVER AL TEMARIO